Alexander Theodor von Middendorff (em russo: Александр Федорович Миддендорф) (São Petersburgo, 18 de agosto de 1815 — Hellenurme, Valgamaa (atual Estônia), 24 de janeiro de 1894) foi um médico, botânico e explorador russo de origem alemã.
Obteve seu título de doutor em medicina na Universidade de Tartu em 1837. Prosseguiu seus estudos em Berlim, Erlangen, Viena e Breslau.
Em 1839 foi professor assistente de zoologia em Kiev.
Tomou parte na expedição de exploração da península de Kola conduzida por Karl Ernst von Baer (1792-1876).
De 1843 a 1845, explorou a Península de Taimir na Sibéria por conta da Academia de Ciências da Rússia. Publicou suas observações em quatro volumes com o título Reise in den äussersten Norden und Osten Sibiriens (1848-1875), onde descreveu os efeitos do permafrost sobre a fauna e a flora.
Aos 40 anos assumiu o cargo de secretário da Academia de Ciências da Rússia em reconhecimento as suas explorações , onde permaneceu até sua aposentadoria em 1860.
Também se interessou pela migração das aves na Rússia, em sua obra Die Isepiptesen Russlands, 1855.
Edward S. Gruson, E.S. 1972. Words for Birds. A Lexicon of North American Birds with Biographical Notes. Quadrangle Books (Nueva York): xiv + 305 p.
E. Tammiksaar, I. Stone. 2007. "Alexander von Middendorff y su expedición a Siberia (1842-1845)", Polar Record 43 (226): 193-216
Barbara and Richard Mearns, Audubon to Xantus, The Lives of Those Commemorated in North American Bird Names, ISBN 0-12-487423-1
(em inglês) Abreviatura oficial e lista de nomes de plantas e fungos atribuídos a Alexander von Middendorff no The International Plant Names Index (IPNI) (em inglês).