Jônatas Domingos (Fortaleza, 29 de julho de 1982) é um ex-futebolista brasileiro, que atuava como volante.
Jônatas foi contratado pelo Flamengo no ano de 2002, durante uma fase na qual o clube carioca atravessava grave crise, lutando sucessivas vezes contra o rebaixamento no Campeonato Brasileiro. Envolvido em um ambiente negativo, Jônatas não conseguiu emplacar e, assim sendo, seu futuro no Flamengo permaneceu incerto durante um bom tempo.
Contudo, em 2006, a situação começou a melhorar no Flamengo e aí o verdadeiro futebol de Jônatas começou a aparecer. Considerado o grande maestro da equipe Rubro-Negra, campeã da Copa do Brasil de 2006, Jônatas acabou aparecendo na primeira convocação da Seleção Brasileira feita por Dunga. A partida foi um amistoso contra a Seleção da Noruega, mas Jônatas não chegou a entrar em campo.
O sucesso na carreira logo despertou o interesse de clubes estrangeiros e, desta forma, logo após a conquista da Copa do Brasil, veio a transferência para o Espanyol, clube de Barcelona. No clube espanhol, fez o gol de empate na final da Copa UEFA, que levou o jogo para as disputa de pênaltis. Nas penalidades, porém, ele perdeu a sua cobrança, indo de herói a vilão no mesmo jogo.
Entretanto, Jônatas não conseguiu se adaptar à Espanha e, em meados de 2007, após uma série de problemas disciplinares, tentou acertar sua volta ao Flamengo.
Na época a negociação acabou não se concretizando, porém, seis meses mais tarde, Jônatas finalmente conseguiu acertar seu retorno à Gávea. Todavia, durante o ano e meio em que ficou à disposição do Flamengo, acabou sendo relegado a um ostracismo total, não tendo sido sequer relacionado para o banco de reservas em diversas ocasiões.
Jônatas cumpriu seu contrato de empréstimo com o Flamengo até o fim, quando então transferiu-se para o Botafogo em meados de 2009, em um novo contrato de empréstimo feito pelo Espanyol a outro clube do Brasil. Sem conseguir firmar-se na equipe do Botafogo, ao término de 2009, Jônatas não teve o contrato renovado para o ano seguinte. Pouco tempo depois seu contrato com o Espanyol também veio a expirar, quando o clube catalão dispensou-o de vez.
Depois de ficar o ano inteiro de 2010 sem jogar, no começo de 2011 Jônatas foi contratado pelo Figueirense, no intuito de reforçar o elenco do clube catarinense para a disputa da Série A do Brasileirão. Jônatas fez apenas cinco partidas pelo Figueirense e não se firmou.
Após ficar três anos sem clube, revelou que ia voltar em 2014, e, em dezembro de 2013, acertou com o Boavista. Teve seu contrato rescindido após o presidente afirmar que ele não recuperará a forma física.
Em janeiro de 2014, acertou com o Icasa.
Dizem que Jonatas tem apenas três dedos em cada pé, afinal ele só inverte o jogo de trivela. Suas inversões de mais de 50 metros impressionaram gigantes do futebol europeu. Em 2006 conseguiu a proeza de ficar uma temporada inteira sem errar um passe.
b. ^ Jogos da Copa Sul-Americana e Liga Europa da UEFA
c. ^ Jogos do Campeonato Goiano, Campeonato Mineiro, Campeonato Carioca e Campeonato Cearense
Campeonato Carioca: 2004, 2008 e 2009
Troféu Cidade de Barcelona: 2006,2007,2010
Troféu Ramón de Carranza: 2010
Vice-Campeão Copa da UEFA de 2006–07