Johann(es) Werner (em latim: Ioannes Vernerus; Nuremberg, 14 de fevereiro de 1468 – maio de 1522) foi um matemático alemão. Foi sacerdote da paróquia em Nuremberg. Trabalhou principalmente com astronomia, matemática e geografia, tendo sido considerado também um exímio Luthier.
Suas obras matemáticas foram nas áreas de trigonometria esférica e seções cônicas. Publicou um trabalho original sobre seções cônicas em 1522, sendo um dos diversos matemáticos algumas vezes creditado pela invenção da prosthaphaeresis, que simplificou cálculos tediosos mediante o uso de fórmulas trigonométricas, algumas vezes denominadas fórmulas de Werner.
Em 1500, ele observou um cometa e manteve observações de seus movimentos de 1º de junho até 24 de junho.
Esse trabalho desenvolveu ainda mais a sugestão de Regiomontanus de que as ocorrências de eclipses e órbitas cometárias poderiam ser usadas para encontrar longitude, oferecendo uma abordagem prática para esse método por meio do bastão cruzado. (A abordagem não resolveu o problema, pois o instrumento não era suficientemente preciso.)
Seu método de apreensão para descrever a precessão dos equinócios, De motu octauæ Sphær, foi postumamente contestado em 1524 por Nicolau Copérnico em A Carta contra Werner.
Ele é mais conhecido por sua obra In Hoc Opere Haec Continentur Nova Translatio Primi Libri Geographicae Cl Ptolomaei, publicada em Nuremberg em 1514, uma tradução da Geografia de Cláudio Ptolomeu. Nele, ele refinou e promoveu a projeção de mapas de Werner, um mapa de projeção cordiforme (em formato de coração) desenvolvido por Johannes Stabius (Stab), de Viena, por volta de 1500. Essa projeção seria usada para mapas mundiais e alguns mapas continentais durante o século XVI e até o século XVII. Foi usado por Mercator, Oronce Fine e Ortelius no final do século XVI para mapas da Ásia e da África. No século XVIII, foi substituída pela projeção Bonne para mapas continentais. A projeção Werner é usada hoje apenas para fins instrucionais e como novidade.
Nesse trabalho, Werner também propôs um método astronômico para determinar a longitude, medindo a posição da lua em relação às estrelas de fundo. A ideia foi posteriormente discutida em detalhes por Petrus Apianus em seu Cosmographicus liber (Landshut 1524) e ficou conhecida como método da distância lunar.
Muitos consideram Werner um pioneiro da meteorologia moderna e da previsão do tempo. Entre 1513 e 1520, Johann Werner fez as primeiras observações regulares das condições climáticas na Alemanha.
In hoc opere haec continentur Nova translatio primi libri geographiae Cl. Ptolomaei: quae quidem translatio verbum: habet e verbo fideliter expressum. Libellus de quattuor terrarum orbis in plano figurationibus.: In idem Georgii Amirucii opusculaum. Appendices, Nürnberg 1514
In hoc opere haec continentur. Libellvs Ioannis Verneri Nvrembergen. Svper Vigintidvobvs Elementis Conicis. Comentarius seu paraphrastica enarratio in vndecim modos conficiendi eius Problematis quod Cubi duplicatio dicitur. Eivsdem. Comentatio in Dionysodori problema, quo data sphæra plano sub data secat ratione, Alivs modus idem problema coficiendi ab eodem Ioanne Vernero nouissime copertus demostratusq; de motu octauæ Sphæræ, Tractatus duo. Summaria enarratio Theoricæ motus octau Sphæræ., Nürnberg, Petrejus 1522
De Triangulis sphaericis libri quatuor; De meteoroscopiis libri sex, Leibzig, B.G. Teubner 1907 [escrito no início do século XVI].
Canones sicut breuissimi, ita etiam doctissimi, complectentes praecepta & obseruationes de mutatione aurae, 1546
Compendiosa institvtio in vniversam dialecticam, ex Aristot., Riuio, aliisque auctoribus recentioribus collecta, nuperrime scholiis philosophicis illustrata