Jonny William Flynn (Niagara Falls, Nova Iorque, 6 de fevereiro de 1989), conhecido simplesmente como Jonny Flynn, é um jogador profissional de basquetebol norte-americano que atua como Armador. Flynn foi selecionado com a 6ª escolha no Draft de 2009, pelos Timberwolves.
Jogou em Minnesota por dois anos sendo trocado para o Houston Rockets em 2011. Em 2012, foi envolvindo em uma troca que o levou para o Portland Trail Blazers. Na temporada 2012/13, Flynn jogou pelos Melbourne Tigers na Liga Australiana. Em 2014, jogou na Itália pelo Orlandina Basket.