Margarida da Saxônia (nome completo: Margaretha Karoline Friederike Cecilie Auguste Amalie Josephine Elisabeth Maria Johanna von Sachsen, Herzogin zu Sachsen) (Dresden, 24 de maio de 1840 – Monza, 15 de setembro de 1858) foi uma arquiduquesa da Áustria como esposa de Carlos Luís da Áustria. Nascida como uma princesa do Reino da Saxônia, era filha do rei João I da Saxônia com sua esposa a princesa Amélia Augusta da Baviera.
Margarida era a oitava filha do rei João I da Saxônia e da princesa Amélia Augusta da Baviera. Dois de seus irmãos foram reis da Saxônia: Alberto I e Jorge I. Entre seus primos (e, posteriormente, cunhados) estavam os imperadores Francisco José I da Áustria (bem como sua esposa, a imperatriz "Sissi") e Maximiliano I do México.
Casou-se aos dezesseis anos de idade, em 4 de novembro de 1856, em Dresden, com seu primo, o arquiduque Carlos Luís da Áustria, filho do arquiduque Francisco Carlos da Áustria e de sua tia, a princesa Sofia da Baviera. A união não foi feliz e não gerou herdeiros.
Margarida morreu de febre tifoide em Monza, em 15 de setembro de 1858, aos dezoito anos de idade. Seu corpo foi sepultado na Cripta Imperial de Viena.
24 de maio de 1840 – 4 de novembro de 1856: Sua Alteza Real, Princesa Margarida da Saxônia, Duquesa de Saxe
4 de novembro de 1856 – 15 de setembro de 1858: Sua Alteza Imperial e Real, Arquiduquesa e Princesa Margarida da Áustria, Princesa da Hungria e Boêmia, Princesa e Duquesa de Saxe