Paulo Arruda (Santa Gertrudes, 5 de abril de 1952) é um biologista e renomado cientista brasileiro na área de biologia molecular e genômica vegetal.
Paulo Arruda é professor titular do Departamento de Genética do Instituto de Biologia da Universidade Estadual de Campinas. Ele recebeu seu Doutorado em Genética pela Universidade Estadual de Campinas e foi pioneiro na biologia molecular e genômica vegetal no Brasil. Seus interesses de pesquisa estão voltados ao entendimento da regulação da expressão gênica e seu impacto no metabolismo de aminoácidos e na resposta a estresses abioticos. Possui mais de 100 artigos científicos publicados em revistas internacionais, é membro da Academia Brasileira de Ciências, da The World Academy of Sciences e da Academia de Ciencias do Estado de São Paulo. Por suas contribuições cientificas recebeu a comenda Grã-Cruz da Ordem Nacional do Mérito Científico do Governo da República do Brasil e o Prêmio de Mérito Científico e Tecnológico do Governo do Estado de São Paulo. Foi um dos sócios fundadores e Diretor Científico da empresa de biotecnologia vegetal Alellyx Applied Genomics. Atualmente deirige o Genomics for Climate Change Research Center e o Centro de Química Medicinal da UNICAMP.
Iniciou sua vida acadêmica ao ingressar para o curso de Ciências Biológicas, na Pontifícia Universidade Católica de Campinas (Puccamp), em 1973, e com concluindo-o em 1976. Posteriormente cursou mestrado (com a dissertação "Síntese de aminoácidos e proteínas: características físicas e químicas em endospermas normais e Opaque2 durante desenvolvimento da semente de milho") e doutorado (com a dissertação "O potencial osmótico em mutantes de endosperma de milho e sua interação com características físicas e com a atividade da RNase da semente") pelo Departamento de Genética da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP), concluindo-os, respectivamente, nos anos de 1979 e 1982.
Terminada a Pós-Graduação, cursou pós-doutorado pelo Departamento de Bioquímica da Rothamsted Experimental Station, Inglaterra, entre 1982 e 1983.
De volta ao Brasil em 1983, iniciou um grupo de pesquisas em biologia molecular de plantas, tema até então incipiente no Brasil. O grupo se consolidou com pesquisas em regulação da biossíntese de aminoácidos e proteínas de reserva em sementes, com grande repercussão internacional. Esta pesquisa serviu como base para o desenvolvimento de plantas ricas em lisina, área de grande interesse biotecnológico para o desenvolvimento de alimentos funcionais. Tratou-se de um estudo pioneiro de "molecular farming" realizado fora dos Estados Unidos, Europa e Japão. Seu grupo também participou de pesquisas com termorregulação em plantas, particularmente o papel da proteína desacopladora de mitocôndrias de plantas (PUMP) no controle da produção de calor em plantas. A partir de 1987, coordenou a implantação do Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG) da UNICAMP, sendo atualmente um centro de referência para a pesquisa em biologia molecular. O laboratório de Biologia Molecular de Plantas do CBMEG, sob sua liderança, já treinou mais de uma centena de estudantes de iniciação científica, mestres, doutores e pós-doutores, muitos dos quais ocupam posições de destaque em instituições de ensino e pesquisa nacionais e internacionais. Participou da organização do Programa Genoma Fapesp, contribuindo com a implantação da rede ONSA para o sequenciamento do genoma da bactéria Xylella fastidiosa, trabalho este que rendeu a capa da revista Nature em 2000, mesmo ano em que foi eleito membro da Academia Brasileira de Ciências. Posteriormente passou a coordenar o Projeto Genoma da Cana de Açúcar (SUCEST) que pretendia identificar cerca de 50.000 genes da cana e estudar o papel funcional dos mesmos.
Fundou, em 2002, juntamente com quatro outros pesquisadores, a Alellyx Applied Genomics,a primeira empresa brasileira de genômica vegetal aplicada, da qual assumiu o cargo de Diretor Científico. A empresa, além de investidores, conta com apoio financeiro do BNDES e parcerias como a CanaVialis. As empresas Alellyx e CanaVialis foram fundadas, ambas, com capital de risco da Votorantim, e juntas permitiram o desenvolvimento de tecnologias que colocam o Brasil em uma posição pioneira no campo de agropesquisas. Em 2008 a empresa foi vendida para a multinacional americana Monsanto, que comprou também a parceira CanaVialis.
Em 2009, após desligar-se da Allelyx, Paulo Arruda retorna à UNICAMP. De volta a universidade, coordenou um projeto de Educação em Ciências denominado Ciência para Todos. O grupo atuou na atualização de estudantes e professores da rede pública da região de Campinas.Em outubro de 2010 é eleito, juntamente com mais oito pesquisadores brasileiros, membro da Academia de Ciências para o Mundo em Desenvolvimento. Atualmente coordena o Laboratório de Estudo da Regulação da Expressão Gênica do CBMEG.
Arruda, P. ; Sodek, L. ; da Silva, W. J.Lysine-Ketoglutarate Reductase Activity in Developing Maize Endosperm. Plant Physiology (Bethesda), v. 69, p. 988-989, 1982.
Arruda, P ; da Silva WJ.Lysine-ketoglutarate reductase activity in maize: Its possible role in lysine metabolism of developing endosperm. Phytochemistry, v. 22, p. 2687-2689, 1983.
Arruda, P. ; Bright, S. W. J. ; Kueh, J. S. H. ; Lea, P. J. ; Rognes, S. E. . Regulation of Aspartate Kinase Isoenzymes in Barley Mutants Resistant to Lysine plus Threonine : Construction and Analysis of Combinations of the Lt1a, Lt1b, and Lt2 Mutant Genes. Plant Physiology (Bethesda), v. 76, p. 442-446, 1984.
Azevedo, R ; Arana, J ; Arruda, P . Biochemical genetics of the interaction of the lysine plus threonine resistant mutant Ltr?1 with opaque-2 maize mutant. Plant Science (Limerick), v. 70, p. 81-90, 1990.
Leite, A. ; de Freitas, F. A. ; Yunes, J. A. ; Arruda, P. . Nucleotide Sequence of a cDNA Clone Encoding -Coixin from Coix lacryma-jobi Seeds. Plant Physiology (Bethesda), v. 97, p. 1604-1605, 1991.
Natividadetargon, M ; Ottoboni, L ; Leite, A ; Ludevid, D ; Puigdomenech, P ; Arruda, P . Synthesis and deposition of coixin in seeds of Coix lacryma-jobi. Plant Science (Limerick), v. 83, p. 169-180, 1992.
Yunes, J. A. ; Cord Neto, G. ; Da Silva, Mj ; Leite, A ; Ottoboni, L. M. M. ; Arruda, P. . The Transcriptional Activator Opaque2 Recognizes Two Different Target Sequences in the 22-kD-like [alpha-Prolamin Genes]. The Plant Cell, USA, v. 6, n. 2, p. 237-249, 1994.
Szajner P ; Torigoi E ; Gonçalves-Butruille, 6. ; Leite, A ; Arruda, P. . Purification and Characterization of the Bifunctional Enzyme Lysine-ketoglutarate Reductase-Saccharopine Dehydrogenase from Maize. Plant Physiology, Maryland, v. 110, p. 765-772, 1996.
Azevedo, R ; Arruda, P ; Turner, W ; Lea, P . The biosynthesis and metabolism of the aspartate derived amino acids in higher plants. Phytochemistry, Inglaterra, v. 46, p. 395-419, 1997.
Yunes, J. A. ; Vettore AL ; Da Silva, Mj ; Leite, A ; Arruda, P. . Cooperative DNA Binding and Sequence Discrimination by the Opaque2 bZIP Factor. The Plant Cell, USA, v. 10, p. 1941-1956, 1998.
Maia, I ; Benedetti, C ; Leite, A ; Turcinelli, S ; Vercesi, A ; Arruda, P .AtPUMP: an gene encoding a plant uncoupling mitochondrial protein. FEBS Letters, Inglaterra, v. 429, p. 403-406, 1998.