A Revolta de Boston de 1689 consistiu num levantamento popular em 18 de Abril de 1689 contra a administração de Sir Edmund Andros, governador do Domínio da Nova Inglaterra. Um grupo popular bem organizado constituído por uma milícia provincial e por cidadãos juntou-se e deteve os oficiais do Domínio. Alguns membros da Igreja de Inglaterra, que eram vistos pelos Puritanos como simpatizantes da Administração do Domínio, também foram detidos pelos rebeldes. Nenhuma das partes sofreu qualquer baixa durante a revolta. Os líderes da Colónia da Baía de Massachusetts tomaram o controlo do governo. Em outras colónias, membros de governos que tinham sido deslocados pelo Domínio, voltaram ao poder.
Andros, governador nomeado pela Nova Inglaterra em 1686, tinha sido mal recebido pela população local ao reforçar a já restritiva Lei da Navegação, negando os títulos das terras já existentes, restringindo as assembleias locais e nomeando oficiais impopulares para chefiar as milícias locais, entre outras medidas. Mais, ele tinha enfurecido os Puritanos de Boston ao defender a Igreja de Inglaterra, a qual não era bem-vista por muitos colonos Não-Conformistas da Nova Inglaterra.
No início da década de 1680, o rei Carlos II de Inglaterra deu os primeiros passos na reorganização das colónias de Nova Inglaterra. O mapeamento da Colónia da Baía de Massachusetts foi cancelada em 1684 depois dos seus administradores puritanos se terem recusado a aceitar as ordens de Carlos para realizar reformas na colónia, quando aquele tentou racionalizar a administração das pequenas colónias, colocando-as, ainda mais, sob seu controlo. O rei morreu em 1685 e o seu sucessor, o católico romano Jaime II, deu continuidade ao processo, o qual culminou na criação do Domínio de Nova Inglaterra.
Em 1686, o ex-governador da Província de Nova Iorque, sir Edmund Andros, foi nomeado para governador do domínio. Este era constituído pelos territórios da Baía de Massachusetts, Plymouth, Connecticut, New Hampshire e colónias de Rhode Island. Em 1688, a sua jurisdição foi alargada para incluir Nova Iorque, Jersey Oriental e Jersey Ocidental.
A forma de governar de Andros era muito impopular na Nova Inglaterra. Desprezava as representações locais, negava a validade dos títulos de propriedade existentes em Massachusetts (que tinham sido definidos por antigos levantamentos realizados na região), restringia as reuniões, e promovia, de forma activa, a Igreja de Inglaterra em regiões maioritariamente puritanas. Da mesma forma, Andros dava especial relevo para as Actos de Navegação, leis desfavoráveis que ameaçavam a existência de certas práticas mercantis na Nova Inglaterra. A tropas reais estacionadas em Boston eram maltratadas pelos seus oficiais, apoiantes do governador, e, habitualmente, anglicanos ou católicos romanos.
Entretanto, em Inglaterra, Jaime estava a tornar-se impopular. O rei tentou acalmar os apoiantes tories com as suas tentativas de suavizar as leis penais, e em 1687 editou a Declaração de Indulgência, onde se estabelecia alguma liberdade religiosa, um gesto que teve a oposição da hierarquia da igreja anglicana. Aumentou o poder do exército regular, decisão vista por muitos membros do Parlamento como uma ameaça à sua autoridade, e nomeou alguns católicos para importantes posições militares. Jaime tentou também colocar alguns simpatizantes no Parlamento os quais, esperava ele, revogou o Acto de Provas, o qual necessitava de um rigoroso teste anglicano para muitos dos gabinetes civis. Com o Nascimento do seu filho e potencial sucessor, James, em Junho de 1688, alguns whigs e tories colocaram de lado as suas diferenças políticas e conspiraram para substituí-lo pelo seu afilhado, protestante, Guilherme, Príncipe de Orange. O príncipe holandês, que tinha tentado, sem resultado, que James reconsiderasse as suas políticas, concordou em realizar uma invasão, e a ”revolução sem sangue” que se seguiu em Novembro e Dezembro de 1688 colocou William e a sua esposa Maria como governantes.
Os líderes religiosos de Massachusetts, liderados por Cotton e Increase Mather, opunham-se à administração de Andros, e organizaram-se para para influenciar a corte em Londres. Após a publicação da Declaração de Indulgência pelo rei Jaime, Increase Mather enviou uma carta de agradecimento ao rei sobre a declaração, e sugeriu a outros religiosos de Massachusetts que fizessem o mesmo como forma de obter favores e influência. Dez deles concordaram em fazê-lo, e decidiram enviar Increase Mather a Inglaterra para que este apresentasse uma reclamação sobre Andros. Apesar das repetidas tentativas por parte do secretário do domínio Edward Randolph de impedir a partida(incluindo acusações criminais), Mather embarcou clandestinamente a bordo de um navio em direcção a Londres, em Abril de 1688. Ele, e outros elementos de Massachusetts, foram recebidos pelo rei que prometeu, em Outubro, que os problemas da colónia seriam resolvidos. No entanto, os acontecimentos originados pela revolução, impediram que as suas acções tivessem efeito.
Os enviados de Massachusetts fizeram uma petição ao novo rei, e aos Lords of Trade (antecessores do Board of Trade que supervisionavam os assuntos coloniais) para restaurar as fronteiras de Massachusetts. Mather também convenceu os Lords of Trade a não informar logo Andros sobre a revolução. Ele já tinha enviado ao anterior governador colonial, Simon Bradstreet, uma carta com um relatório (preparado antes da revolução) a informar que o cancelamento do mapeamento da região de Massachusetts era ilegal, e que os magistrados deviam "preparar as mentes das pessoas para uma mudança." Os rumores da revolução terão chegado até alguns elementos em Boston antes mesmo das informações oficiais. John Nelson, um comerciante de Boston que se destacou na revolta, escreveu sobre os acontecimentos numa carta datada de finais de Março, e a carta incitava a uma reunião de elementos superiores que eram contra os líderes políticos e religiosos de Andros em Massachusetts.
Andros recebeu um primeiro aviso sobre a iminente revolta contra a sua administração enquanto liderava uma expedição para fortificar Pemaquid (actual Bristol, Maine), para a zona contra ataques dos franceses e dos índios. No início de Janeiro de 1688/9, Andros recebeu uma carta de Jaime onde era descrito a instalação das tropas holandesas. A 10 de Janeiro, emitiu uma proclamação contra a agitação protestante, e proibiu qualquer revolta contra o domínio. A força militar que ele comandava no Maine era composta por tropas regulares e milícias do Massachusetts e de Maine. As companhias de milícias eram comandadas por militares que impunham uma dura disciplina. Alertado para as reuniões que tinham lugar em Boston, e na posse de informações não oficiais acerca da revolução, Andros regressou a Boston. Por entre rumores de que Andros os tinha levado até ao Maine para fazerem parte do chamado "conspiração papista", a milícia amotinou-se, e os que eram de Massachusetts começaram a regressar a casa. Quando uma cópia da proclamação anunciando a revolução chegou a Boston no início de Abril, Andros mandou prender o mensageiro; no entanto, as notícias foram difundidas, encorajando a população. Em 16 de Abril, Andros escreveu ao seu comandante em Pemaquid informando que "há uma agitação entre a população, que tem grandes expectativas acerca ddas suas anteriores fronteiras", mesmo tendo em conta que ele estava a preparar a detenção dos desertores que regressavam e os ia enviar para o Maine. A ameaça de detenções pela sua própria milícia colonial aumentou as tensões entre os cidadãos de Boston e o governo do domínio.
Pelas 5h00 do dia 18 de Abril, as companhias de milícias começaram a reunir-se fora de Boston em Charlestown, junto ao Charles River e a Roxbury, situada no extremo do istmo que ligava Boston ao continente. Cerca das 8h00, as companhias de Charlestown embarcaram em barcos e atravessaram o rio, enquanto as de Roxbury marcharam pelo istmo até à cidade. Em simultâneo, os conspiradores da Antiga e Honrosa Companhia de Artilharia entraram em casa dos bateristas dos regimentos na cidade, e confiscaram os seus equipamentos. Vendo o seu número aumentado por populares, as companhias de milícias reuniram-se pelas 8h30 e começaram a deter os líderes dos regimentos e dos domínios. Acabaram por cercar o Forte Mary, onde Andros se encontrava refugiado.